Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGSM1Q2NKQ1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms