Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSPP1Q1MSJ5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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