Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HIST3H3Q16695 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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HIST3H3Q16695 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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