Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDKN3Q16667 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms