Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FXNQ16595 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms