Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DDB1Q16531 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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DDB1Q16531 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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