Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ZFHX3Q15911 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms