Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA2Q15822 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA2Q15822 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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