Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITSN1Q15811 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms