Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF1AQ15573 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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