Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PTPRRQ15256 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRRQ15256 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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