Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIXQ14938 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms