Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SSPNQ14714 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms