Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms