Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM53BQ14153 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms