Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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SHROOM2Q13796 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHROOM2Q13796 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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