Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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HTR4Q13639 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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HTR4Q13639 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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HTR4Q13639 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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HTR4Q13639 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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