Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH18Q13634 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH18Q13634 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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