Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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