Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms