Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F3Q08477 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms