Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RELAQ04206 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELAQ04206 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELAQ04206 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RELAQ04206 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.9 ms