Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DSC2Q02487 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DSC2Q02487 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms