Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms