Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BNC1Q01954 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms