Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DEFA6Q01524 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms