Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLTCQ00610 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms