Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms