Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP2C1P98194 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms