Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HBBP68871 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HBBP68871 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HBBP68871 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
HBBP68871 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
HBBP68871 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms