Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms