Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms