Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MCCD1P59942 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms