Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBASH3AP57075 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms