Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAD23BP54727 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms