Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAD23AP54725 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAD23AP54725 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAD23AP54725 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAD23AP54725 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RAD23AP54725 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAD23AP54725 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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