Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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CENPFP49454 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CENPFP49454 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPFP49454 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPFP49454 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPFP49454 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CENPFP49454 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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