Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTRNP46939 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UTRNP46939 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTRNP46939 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UTRNP46939 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms