Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC097478.3-201ENST00000620420 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CSTA-202ENST00000479204 821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC005785.2-201ENST00000624655 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSG3P32926 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSG3P32926 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms