Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1CAMP32004 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1CAMP32004 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms