Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDM5AP29375 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDM5AP29375 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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