Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID4AP29374 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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