Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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PKHD1P08F94 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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