Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOP3BO95985 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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