Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC28A2O43868 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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