Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KDELR3O43731 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms