Protein–RNA interactions for Protein: K7ESF4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
K7ESF4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
K7ESF4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
K7ESF4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
K7ESF4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
K7ESF4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
K7ESF4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
K7ESF4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
K7ESF4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
K7ESF4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
K7ESF4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms