Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PCH4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PCH4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PCH4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PCH4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms