Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
USP17L23D6RBM5 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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