Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGB1P1B2RPK0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMGB1P1B2RPK0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms